Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col1a1P11087 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a1P11087 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a1P11087 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms