Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc6P10629 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms