Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UbbP0CG49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms