Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms