Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc9P09633 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc9P09633 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms