Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc8P09025 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms