Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms