Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna5P07349 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms