Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf3P05524 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf3P05524 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms