Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01801 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01801 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01801 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01801 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01801 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01801 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01801 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01801 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01801 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01801 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01801 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01801 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01801 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms