Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01790 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01790 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01790 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01790 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01790 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01790 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01790 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01790 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01790 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01790 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms