Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms