Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp8O89110 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp8O89110 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp8O89110 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms