Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3bO88509 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms