Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms