Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a1O88207 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a1O88207 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a1O88207 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms