Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfnO70456 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfnO70456 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfnO70456 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfnO70456 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfnO70456 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfnO70456 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfnO70456 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfnO70456 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfnO70456 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfnO70456 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms