Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx7O70439 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx7O70439 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms