Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf5O70191 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf5O70191 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf5O70191 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms