Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trdmt1O55055 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trdmt1O55055 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms