Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prom1O54990 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom1O54990 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom1O54990 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms