Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DffaO54786 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DffaO54786 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DffaO54786 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DffaO54786 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DffaO54786 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DffaO54786 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DffaO54786 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DffaO54786 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DffaO54786 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DffaO54786 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DffaO54786 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DffaO54786 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DffaO54786 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DffaO54786 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DffaO54786 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DffaO54786 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DffaO54786 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DffaO54786 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DffaO54786 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DffaO54786 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DffaO54786 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DffaO54786 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms