Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms