Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpibO35906 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpibO35906 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpibO35906 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SpibO35906 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpibO35906 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpibO35906 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpibO35906 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpibO35906 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpibO35906 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpibO35906 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpibO35906 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpibO35906 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpibO35906 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpibO35906 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpibO35906 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpibO35906 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SpibO35906 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SpibO35906 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SpibO35906 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SpibO35906 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms