Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn1mwO35599 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn1mwO35599 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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