Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd2O35392 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms