Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Q1O19441 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms