Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casq1O09165 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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