Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn1O08788 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms