Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4dL7N216 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4dL7N216 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms