Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms