Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c2J3QNM1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms