Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp17lcG5E8I7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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