Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms