Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf148G3X9R7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms