Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XntrpcF8VQM8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XntrpcF8VQM8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XntrpcF8VQM8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms