Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5830473C10RikF8VQ07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5830473C10RikF8VQ07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms