Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
D430041D05RikF6ZGR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
D430041D05RikF6ZGR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms