Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3072F6SKY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms