Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngap1F6SEU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms