Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC030500E9Q6W0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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BC030500E9Q6W0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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