Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tarbp1E9Q368 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms