Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc171E9Q1U1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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