Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Myo5cE9Q1F5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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