Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx60E9PZQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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