Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30bE9PVL6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim30bE9PVL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms