Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Piezo1E2JF22 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms