Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms