Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsbn1lD3Z0K6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsbn1lD3Z0K6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms