Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol6B7ZC55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms